IAIN Ponorogo mengembangkan nilai inti dan budaya organisasi yang bersumber dari AI-Qur’an Surat AI-Mujadalah (11), yang artinya “..niscaya Allah akan meninggikan orang-orang yang beriman di antaramu dan orang-orang yang diberi ilmu pengetahuan beberapa derajat dan Allah Maha mengetahui apa yang kamu kerjakan.

Selain itu juga didasarkan pada nilai-nilai pada Al-Qur’an Surat Al-Alaq 1-5, yang artinya  (1) bacalah dengan (menyebut) nama Tuhanmu yang Menciptakan, (2)  Dia telah menciptakan manusia dari segumpal darah, (3) Bacalah, dan Tuhanmulah yang Maha pemurah, (4)  yang mengajar (manusia) dengan perantaran kalam, (5)  Dia mengajar kepada manusia apa yang tidak diketahuinya.

Mensinergikan antara iman (implementasi Agama dalam arti ilmu-ilmu keislaman sebagai pedoman hidup), ilmu (implementasi dari ilmu pengetahuan umum sebagai jalan hidup), dan amal (implementasi dari akhlak dan moralitas sebagai wujud dari sikap hidup) menjadi ranah pendidikan di Institut Agama Islam Negeri  Ponorogo yang lebih penting dari ranah kognitif, afektif, normatif dan psikomotorik. Dengan merajut paradigma interkoneksi antar agama, ilmu dan moral akan memiliki implikasi saling mengapresiasi dan saling memberdayakan nilai kebenaran universal umumnya, dan keislaman khususnya dalam proses pembelajaran.

VISI
Sebagai Pusat Kajian Dan Pengembangan Ilmu Keislaman Yang Unggul Dalam Rangka Mewujudkan Masyarakat Madani


MISI
a. Menghasilkan sarjana di bidang ilmu-ilmu keislaman yang unggul dalam kajian materi dan penelitian
b. Menghasilkan sarjana yang mampu mewujudkan civil society
c.  Menghasilkan sarjana yang berkarakter dan toleran


Tujuan
a. Memberikan akses Pendidikan Tinggi Keislaman kepada masyarakat dengan tata kelola yang baik
b. Menyiapkan human resources yang terdidik
c.  Menghasilkan penelitian dan pengabdian kepada masyarakat yang berkualitas.